От «Нет доступного лечения» до «Нет признаков заболевания»: обзор пути борьбы с раком соисполнительного директора GitLab с помощью ИИ-ассистированного пути борьбы с раком (AI-Assisted Cancer Journey)

Согласно мониторингу 1M AI News, Сид Сийбрандидж, сооснователь и исполнительный председатель GitLab, недавно поделился на мероприятии OpenAI Forum своим полным опытом применения ИИ для борьбы с остеосаркомой вместе с генетиком Джейкобом Стерном. Сиду диагностировали спинальную остеосаркому в конце 2022 года, опухоль имела диаметр 6 сантиметров. После операции, спинальной фузии, лучевой терапии и высокоинтенсивной химиотерапии в 2023 году в 2024 рак рецидивировал: стандартные варианты лечения в значительной степени были исчерпаны, а его лечащий врач не мог порекомендовать эффективные дальнейшие шаги. Затем Сид отошел от своих ежедневных обязанностей, чтобы сформировать личную медицинскую команду, возглавляемую бывшим руководителем 10x Genomics Джейкобом Стерном, взяв под полный контроль решения по своему лечению в режиме «founder mode». Команда приняла стратегию «extreme diagnostics», проводя всесторонние анализы опухоли с помощью одноклеточного секвенирования, ДНК/РНК-секвенирования, таргетной визуализации и тестирования органоидов, в результате получив суммарно 25TB данных. Одноклеточное секвенирование выявило высокую экспрессию белка FAP в опухоли, что привело команду к поиску экспериментальной радиоактивной лигандной терапии, нацеленной на FAP, в Германии. После двух курсов лечения некроз опухоли достиг 60%, размер уменьшился на 20%, а опухоль отделилась от твердой мозговой оболочки (dura), что позволило хирургам снова выполнить операцию и удалить ее. На протяжении всего процесса ИИ выступал как ускоритель. Джейкоб напрямую ввел данные секвенирования РНК опухоли в GPT-4 для анализа, где ИИ определил затем ключевой таргет B7H3 и охарактеризовал динамические особенности опухолевого иммунного микроокружения. Команда также разработала систему Agent, которая автоматически проводит поиск литературы, генерацию гипотез и био информатический анализ при вводе вопросов на естественном языке, обходясь примерно в $20 за один запуск и занимая 30 минут на анализ и генерацию отчетов по 600,000 одно-клеточным точкам данных. ИИ также использовали, чтобы помогать в скрининге кандидатов неоантигенов при разработке персонализированных мРНК-вакцин от опухоли. Джейкоб отметил, что хотя ИИ не может заменить специалистов, он дает ему возможность быть квалифицированным собеседником со специалистами, позволяя быстро вступать в работу и продвигать сотрудничество в областях, где он не является экспертом. Сид заявил, что после таргетного радиоактивного лечения и операции в настоящее время он находится в состоянии «no evidence of disease», а доступные варианты лечения расширились с нуля до тридцати. Команда работает над коммерциализацией этого подхода: компании вроде Thalus (анализ экспрессии генов и поиск таргетов) и Arden (персонализированное лечение сложных иммунных заболеваний) были инкубированы, и цель состоит в том, чтобы снизить барьеры для персонализированного лечения.