1M AI Newsによるモニタリングによると、GitLabの共同設立者兼エグゼクティブ・チェアマンであるSid Sijbrandijは、OpenAI Forumのイベントで、遺伝学者のJacob Sternとともに、AIを用いて骨肉腫と闘うために自身が実施してきた全ての経験を最近共有した。Sidは2022年末に脊椎骨肉腫と診断され、腫瘍の直径は6センチメートルだった。2023年に手術、脊椎固定術、放射線治療、高強度化学療法を受けた後、がんは2024年に再発し、標準的な治療選択肢はほぼ尽きており、主治医は有効な次の一手を勧められなかった。その後Sidは日々の職務を退き、元10x Genomicsの幹部であるJacob Sternが率いる個人の医療チームを結成し、「ファウンダーモード」で治療の意思決定を全面的に自分で行えるようにした。チームは「エクストリーム・ダイアグノスティックス（極限の診断）」という戦略を採用し、単一細胞シーケンシング、DNA/RNAシーケンシング、ターゲット画像診断、オルガノイド検査によって腫瘍を徹底的に分析し、合計25TBのデータを生成した。単一細胞シーケンシングにより、腫瘍内でFAPタンパク質の高い発現が明らかになり、チームはドイツでFAPを標的とする実験的な放射性リガンド治療を見つけた。2回の治療の後、腫瘍壊死は60%に達し、サイズは20%縮小し、脊椎硬膜から剥離したため、外科医が再び手術を行ってそれを取り除けるようになった。AIはプロセス全体を通して加速装置の役割を果たした。Jacobは腫瘍のRNAシーケンシングデータを直接GPT-4に投入して解析し、そこでAIがその後に重要となったB7H3標的を特定し、腫瘍の免疫微小環境の動的な特徴を特徴づけた。チームはまた、自然言語の質問を入力するだけで、文献検索、仮説生成、生物情報学的解析を自動で行うエージェント・システムを開発し、1回の実行コストは約$20で、60万の単一細胞データポイントを解析してレポートを生成するのに30分かかる。AIは、個別化したmRNA腫瘍ワクチンを設計する際に、候補となるネオアンチゲンのスクリーニングを支援するためにも使われた。Jacobは、AIは専門家の代わりにはならない一方で、専門家との有資格の対話者として自分を強化し、自分が専門ではない領域でも素早く関与して協業を前進させられるようにしてくれる、と述べた。Sidは、標的放射性治療と手術の後、現在「無病の状態（no evidence of disease）」にあり、利用可能な治療選択肢がゼロから30にまで拡大したと述べた。チームはこのアプローチを商業化するために取り組んでおり、Thalus（遺伝子発現解析と標的探索）やArden（複雑な免疫疾患に対する個別化治療）といった企業をインキュベートしてきた。個別化治療のハードルを下げることを目指している。
「治療法なし」から「疾患の証拠なし」へ：GitLab共同創業者のAI支援がん治療の軌跡に関するレビュー
1M AI Newsによるモニタリングによると、GitLabの共同設立者兼エグゼクティブ・チェアマンであるSid Sijbrandijは、OpenAI Forumのイベントで、遺伝学者のJacob Sternとともに、AIを用いて骨肉腫と闘うために自身が実施してきた全ての経験を最近共有した。Sidは2022年末に脊椎骨肉腫と診断され、腫瘍の直径は6センチメートルだった。2023年に手術、脊椎固定術、放射線治療、高強度化学療法を受けた後、がんは2024年に再発し、標準的な治療選択肢はほぼ尽きており、主治医は有効な次の一手を勧められなかった。その後Sidは日々の職務を退き、元10x Genomicsの幹部であるJacob Sternが率いる個人の医療チームを結成し、「ファウンダーモード」で治療の意思決定を全面的に自分で行えるようにした。チームは「エクストリーム・ダイアグノスティックス（極限の診断）」という戦略を採用し、単一細胞シーケンシング、DNA/RNAシーケンシング、ターゲット画像診断、オルガノイド検査によって腫瘍を徹底的に分析し、合計25TBのデータを生成した。単一細胞シーケンシングにより、腫瘍内でFAPタンパク質の高い発現が明らかになり、チームはドイツでFAPを標的とする実験的な放射性リガンド治療を見つけた。2回の治療の後、腫瘍壊死は60%に達し、サイズは20%縮小し、脊椎硬膜から剥離したため、外科医が再び手術を行ってそれを取り除けるようになった。AIはプロセス全体を通して加速装置の役割を果たした。Jacobは腫瘍のRNAシーケンシングデータを直接GPT-4に投入して解析し、そこでAIがその後に重要となったB7H3標的を特定し、腫瘍の免疫微小環境の動的な特徴を特徴づけた。チームはまた、自然言語の質問を入力するだけで、文献検索、仮説生成、生物情報学的解析を自動で行うエージェント・システムを開発し、1回の実行コストは約$20で、60万の単一細胞データポイントを解析してレポートを生成するのに30分かかる。AIは、個別化したmRNA腫瘍ワクチンを設計する際に、候補となるネオアンチゲンのスクリーニングを支援するためにも使われた。Jacobは、AIは専門家の代わりにはならない一方で、専門家との有資格の対話者として自分を強化し、自分が専門ではない領域でも素早く関与して協業を前進させられるようにしてくれる、と述べた。Sidは、標的放射性治療と手術の後、現在「無病の状態（no evidence of disease）」にあり、利用可能な治療選択肢がゼロから30にまで拡大したと述べた。チームはこのアプローチを商業化するために取り組んでおり、Thalus（遺伝子発現解析と標的探索）やArden（複雑な免疫疾患に対する個別化治療）といった企業をインキュベートしてきた。個別化治療のハードルを下げることを目指している。