Dari 'Tidak Ada Pengobatan yang Tersedia' hingga 'Tidak Ada Bukti Penyakit': Tinjauan Perjalanan Kanker Bantu AI dari Co-founder GitLab

Menurut pemantauan dari 1M AI News, Sid Sijbrandij, pendiri sekaligus ketua eksekutif GitLab, baru-baru ini membagikan pengalaman lengkapnya menggunakan AI untuk memerangi osteosarkoma dalam acara OpenAI Forum, bersama ahli genetika Jacob Stern. Sid didiagnosis mengalami spinal osteosarcoma pada akhir 2022, dengan tumor berukuran 6 sentimeter diameter. Setelah menjalani operasi, fusi tulang belakang (spinal fusion), terapi radiasi, dan kemoterapi berintensitas tinggi pada 2023, kankernya kambuh pada 2024, ketika opsi perawatan standar sebagian besar sudah habis dan dokter utamanya tidak dapat merekomendasikan langkah berikutnya yang efektif. Sid kemudian mengundurkan diri dari tanggung jawab rutinnya untuk membentuk tim medis pribadinya, dipimpin oleh mantan eksekutif 10x Genomics Jacob Stern, mengambil kendali penuh atas keputusan perawatannya dalam “founder mode”. Tim tersebut mengadopsi strategi “diagnostik ekstrem”, melakukan analisis menyeluruh terhadap tumor melalui single-cell sequencing, DNA/RNA sequencing, pencitraan terarah, dan pengujian organoid, sehingga menghasilkan total 25TB data. Single-cell sequencing menunjukkan ekspresi tinggi protein FAP dalam tumor, yang membuat tim menemukan terapi ligan radioaktif eksperimental yang menargetkan FAP di Jerman. Setelah dua kali perawatan, nekrosis tumor mencapai 60%, ukurannya berkurang 20%, dan tumor terlepas dari dura spinal, sehingga memungkinkan para ahli bedah untuk beroperasi lagi dan mengangkatnya. AI berperan sebagai pendorong (accelerator) sepanjang proses. Jacob secara langsung memasukkan data RNA sequencing tumor ke GPT-4 untuk analisis, tempat AI mengidentifikasi target B7H3 yang kemudian menjadi krusial serta mengkarakterisasi fitur dinamis dari lingkungan imun mikro tumor. Tim ini juga mengembangkan sistem Agent yang secara otomatis melakukan pencarian literatur, pembentukan hipotesis, dan analisis bioinformatika saat diberi input pertanyaan dalam bahasa alami, dengan biaya sekitar $20 per sekali jalan dan memerlukan 30 menit untuk menganalisis serta menghasilkan laporan dari 600,000 titik data single-cell. AI juga digunakan untuk membantu penyaringan kandidat neoantigen saat merancang vaksin tumor mRNA yang dipersonalisasi. Jacob mencatat bahwa meskipun AI tidak dapat menggantikan spesialis, AI memberdayakannya untuk menjadi lawan bicara yang berkualifikasi bersama para spesialis, sehingga ia dapat dengan cepat terlibat dan mendorong kolaborasi di bidang yang bukan keahliannya. Sid menyatakan bahwa setelah terapi radiasi tertarget dan operasi, saat ini ia berada dalam kondisi “no evidence of disease”, dengan opsi perawatan yang tersedia diperluas dari nol menjadi tiga puluh. Tim sedang berupaya mengkomersialkan pendekatan ini, setelah menginkubasi perusahaan seperti Thalus (analisis ekspresi gen dan penemuan target) dan Arden (perawatan personal untuk penyakit imun kompleks), dengan tujuan menurunkan hambatan terhadap perawatan yang dipersonalisasi.