Pada tahun 1993, tiga sosok misterius dengan topeng muncul di sampul majalah Wired. Mereka adalah Eric Hughes, matematikawan dari Berkeley, Timothy May, mantan ilmuwan Intel, dan John Gilmore, ahli informatika dan salah satu pendiri Electronic Frontier Foundation. Mereka disebut sebagai kriptopanx, dan artikel Stephen Levy "Kryptopemberontak" menjadi penyebutan pertama tentang mereka di media mainstream.

Pada akhir tahun 1992, ketiga orang ini mengumpulkan 20 teman untuk pertemuan informal guna membahas masalah pemrograman dan kriptografi. Pertemuan ini menjadi bulanan dan diadakan di kantor Cygnus Solutions, yang dimiliki oleh Gilmore. Pada salah satu pertemuan awal, kelompok ini dijuluki "cipherpunks" - permainan kata antara "ciphering" dan "cyberpunk".

Kelompok itu berkembang, dan diputuskan untuk membuat buletin untuk menarik orang-orang seide di luar San Francisco. Buletin tersebut dengan cepat mendapatkan popularitas, mengumpulkan ratusan pelanggan yang saling bertukar ide dan mendiskusikan metode enkripsi baru, seperti PGP. Ini memungkinkan ide-ide menyebar ke seluruh dunia.

Diskusi mencakup berbagai topik: dari matematika dan kriptografi hingga informatika, politik, dan filosofi. Meskipun kesepakatan dalam kelompok tidak selalu tercapai, kelompok ini tetap menjadi wadah terbuka yang sangat menghargai privasi dan kebebasan pribadi.

Ide-ide kunci dari kriptoanarkis diungkapkan dalam "Manifesto Kriptoanarkis", yang ditulis oleh Eric Hughes pada tahun 1993. Poin utama dalam manifesto ini adalah pentingnya privasi. Dokumen tersebut juga memuat ide-ide yang kemudian terwujud dalam kripto.

Dalam beberapa tahun berikutnya, beberapa upaya dilakukan untuk menciptakan sistem transaksi anonim. Pada tahun 1997, Dr. Adam Back mengembangkan sistem Hashcash untuk melindungi dari spam, yang mengharuskan kekuatan komputasi untuk mengirim email. Pada tahun 1998, Wei Dai memperkenalkan B-Money, yang menawarkan metode untuk menyimpan data transaksi. Pada tahun 2004, Hal Finney menciptakan bukti kerja yang dapat digunakan kembali, dan pada tahun 2005, Nick Szabo mempersembahkan proyek Bitgold.

Namun, terobosan nyata terjadi pada bulan Oktober 2008, ketika Satoshi Nakamoto mengirimkan karyanya ke daftar distribusi cypherpunks. Di dalamnya, ia menganalisis masalah yang dihadapi oleh para pengembang sebelumnya dan menawarkan solusi, termasuk masalah pengeluaran ganda. Pada bulan Januari 2009, Nakamoto menambang blok pertama Bitcoin, memulai era kripto.