NVIDIA通过BioNeMo工具包扩展生命科学AI基础设施，用于自动化科学发现 | Metaverse Post

简要介绍

英伟达推出BioNeMo Agent工具包，使AI代理能够访问用于蛋白质研究、分子设计和基因组分析的先进工具。

科技公司英伟达推出了BioNeMo Agent工具包，这是一个开源工具包，旨在为AI代理提供访问生物研究专用工具的能力，包括蛋白质结构预测、分子对接、生成化学、基因组分析以及其他计算生物学应用。

据英伟达介绍，该工具包旨在将其加速的数字生物学平台转变为一套面向代理的能力，使AI系统能够选择、操作和解释先进的科学模型。该平台结合了英伟达BioNeMo服务、优化模型和支持技术，帮助自动化复杂的研究工作流程。

该工具包通过英伟达NIM和BioNeMo开源模型提供一系列生物分子能力，包括蛋白质结构预测、分子生成、序列设计、生物搜索和基因组分析。这些服务由英伟达技术支持，如用于结构模型的cuEquivariance和用于基因组工作负载的Parabricks，确保超越标准硬件加速的优化性能。

平台的一个关键特性是引入BioNeMo Skills，将科学模型打包成有文档的可调用工具，供AI代理使用。每个技能都包括模型的用途、所需输入、可用参数、预期输出和潜在限制的信息。对于尚未通过英伟达NIM提供的模型，模型上下文协议（MCP）服务器集成提供类似的面向代理的接口。

AI驱动的研究工作流程与部署选项

BioNeMo Agent工具包旨在支持AI驱动的研究工作流程，代理可以选择合适的模型、准备输入、分析结果并优化实验。支持的工作流程示例包括生成序列比对、预测蛋白质结构、设计分子以及评估蛋白质与化合物的相互作用。

该平台允许研究人员和开发者在托管的英伟达NIM服务和本地部署选项之间进行选择。托管服务提供更快的访问速度，无需团队管理基础设施，而本地部署则提供更大的控制权，适用于延迟、安全性和重复计算任务。

英伟达表示，BioNeMo Skills旨在简化生物AI模型的部署和使用，消除管理依赖关系和从源代码运行模型的技术障碍。这种方法使AI代理能够通过迭代研究周期工作，包括生成候选、审查输出、调整参数和重复实验。

据英伟达称，内部评估显示，使用BioNeMo Skills的AI代理在任务完成性能方面优于未使用额外工具的代理。公司还报告工具使用效率提高，代理在消耗更少资源的情况下完成了更多成功的工作流程步骤。

该工具包支持多种科学输出，包括分子结构文件、序列格式和化学表示，允许代理处理和解释不同研究应用中的结果。

英伟达将BioNeMo Agent工具包定位为开发AI驱动科学助手的基础，能够与先进的生物模型交互。该平台结合了加速计算基础设施、专业AI模型和基于代理的工具，支持更高效、更可扩展的生物分子研究方法。